Ihre Erwartungen an diesen Workshop

Lernziele

TEIL EINFÜHRUNG

1. Relevanz von Reproduzierbarkeit vermitteln

TEIL MARKDOWN

1. Nützlichkeit/Anwendungsfälle von Markdown vermitteln
2. Kompetenz für typische Anwendungsfälle (für Markdown) vermitteln

TEIL GIT

1. Nützlichkeit/Anwendungsfälle von Git vermitteln
2. Grundkompetenz (von Git) vermitteln

Was ist das Wesensmerkmal der Wissenschaft?

Das Ein Wesensmerkmal der Wissenschaft ist Transparenz.

Wissenschaft heißt zeigen, nicht glauben.

Transparenz ist notwendig für Reproduzierbarkeit

reproducibility refers to the ability of a researcher to duplicate the results of a prior study using the same materials as were used by the original investigator. [GFI16].

Ein Forschungsbericht sollte wie ein Kochrezept sein: Alle Informationen sind enthalten, um das Gericht jeweils (ausreichend) gleich nachzukochen.

⚡ Ist ein Forschungsergebnis nicht reproduzierbar, sind wir zum (Nicht-)Glauben gezwungen. Das ist keine Wissenschaft.

Open Science: Open data, open materials, open code, literate programming ...

Beispiel: Projekt TIER

Project TIER (Teaching Integrity in Empirical Research) promotes the integration of principles and practices related to transparency and replicability in the research training of social scientists.

Our goal is to reach a day in which training in research transparency becomes standard and ubiquitous in the education of social scientists.

Aber haben wir ein Problem mit geringer Reproduzierbarkeit?

[Bak16]

Ja.

Was sind die Ursachen geringer Reproduzierbarkeit?

• Fehlende Informationen
• Fehlende Nachvollziehbarkeit
• Copy-Paste-Fehler
• Keine Syntax
• Keine frei nutzbaren Messinstrumente
• Software-Updates
• Verwendete Software nicht mehr verfügbar
• Verwendete Werkzeuge zu teuer
• ...

Reproduzierbarkeit in typischer Forschungsarbeit

Ein prominenter Forscher zu "Point-and-Click"

Wäre es nicht schön ... 1/2

Wäre es nicht schön ... 2/2

x1 = rechne(Input_Data)
x2 = rechne_mehr(x1)
x3 = irgendwas(x2)
x4 = wildes_zeugs(x3)

Es geht: Z.B. mit Markdown

# Ich bin ein Titel.
Ich bin ein Satz.
Eine Liste beginnt.
- ja
- nein
- vielleicht
Eine nummerierte Liste:
1. 3.4145
2. 2.7182
3. 42

Markdown ist fast WYSIWYG

__fett__, 
_kursiv_, 
~~durchgestrichen~~

Noch mehr Markdown

# Title level 1
## Title level 2
Link:  [my blog](https://data-se.netlify.com/)
Citation: [@Xie2018]
Image: ![my image](imgs/R-logo_small.png)

.pull_right[

Title level 1

Title level 2

Link: my blog.

Citation: (Xie & Allaire, 2018)

Image:

Bilder einfügen

• via Markdown:

  ![my image](imgs/R-logo_small.png)

• via HTML:

  <img src="http://bit.ly/wiki-toddy" width="15%" align="right" />

• via R:

  knitr::include_images("path_to_image")

Tipp: RStudio-Snippets anlegen für häufige Idiome.

Markdown ist eine Markup-Sprache

Markup-Sprachen nutzen Auszeichungen zur Formatierung von Text. Sie basieren auf Textdateien.

Bekannte Beispiele:

• HTML
• LaTeX
• XML
• Word (ist XML)
• Powerpoint (ist XML)
• ...

Markdown ist eine sehr einfache Markup-Sprache (daher "Mark-Down").

🏋 Übung: Erstellen Sie ein Markdown-Dokument in RStudio!

1. In RStudio: File > New File > R Markdown > ... OK
2. Löschen Sie alles, was in der Datei schon steht
3. Schreiben Sie ein paar Zeilen in Markdown
4. Klicken Sie auf "Knit" (engl. für stricken) oder drücken Sie Strg-Shift-K

Erklärvideo

Markdown is nicht Latex

\makeatletter
\newenvironment{kframe}{%
\medskip{}
\setlength{\fboxsep}{.8em}
 \def\at@end@of@kframe{}%
 \ifinner\ifhmode%
  \def\at@end@of@kframe{\end{minipage}}%
  \begin{minipage}{\columnwidth}%
 \fi\fi%
 \def\FrameCommand##1{\hskip\@totalleftmargin \hskip-\fboxsep
 \colorbox{shadecolor}{##1}\hskip-\fboxsep
     % There is no \\@totalrightmargin, so:
     \hskip-\linewidth \hskip-\@totalleftmargin \hskip\columnwidth}%
 {\par\unskip\endMakeFramed%
 \at@end@of@kframe}
\makeatother

Zum Glück.

Ich, als ich neulich kurz was in meiner Latex-Präambel ändern wollte

Markdown als lingua franca der Markup-Sprachen

Mit dem Programm Pandoc lassen sich Markup-Sprachen ineinander übersetzen.

Kurz mal Pause ...

R + Markdown = RMarkdown

# Überschrift Ebene 1
Bla bla bla.
__Fettdruck, weil dicke Hose__
```{r}
x <- 2^10
``` 
Die Lösung ist `r x`.

R-Diagramme

Auf dem üblichen Weg:

gf_point(mpg ~ hp, data = mtcars) %>% 
  gf_lm()

🏋 Übung: Erstellen Sie ein RMarkdown-Dokument in RStudio!

Sie können mit diesem Code beginnen und dann nach eigenem Belieben anpassen:

# Überschrift Ebene 1
Bla bla bla.
__Fettdruck, weil dicke Hose__
```{r}
x <- 2^10
``` 
Die Lösung ist `r x`.

Markdown ist schon ziemlich cool

Was sind die Metadaten eines Dokuments?

Metadaten sind Daten über Daten (hier: über ein Dokument), z.B.

• Titel

• Autor

• Papiergröße

• ...

Metadaten in RMarkdown

Metadaten werden in RMarkdown in einem Bereich, der mit --- vorne und hinten abgegrenzt ist, definiert:

--- 
title: "Das ist der Titel des Dokuments"
author: "Hier steht der Name des Authors"
date: 2019-09-16  # Man kann auch R-Inline-Befehle einflechten
---

Das Format ist i.d.R. Variable = Wert.

Genauer gesagt wird das (YAML-)Format verwendet.

Meist steht dieser Bereich zu Beginn des Dokuments (daher "YAML-Header").

🏋 Übung: Fügen Sie Ihrem Rmd-Dokument einen YAML-Header hinzu!

---
title: "Das ist der Titel des Dokuments"
author: "Hier steht der Name des Authors"
date: `r Sys.Date()`
---
# Überschrift Ebene 1
Bla bla bla.
__Fettdruck, weil dicke Hose__
```{r}
x <- 2^10
```
Die Lösung ist `r x`.

RMarkdown-Ablauf

Berichte

Bücher

Folien (z.B. mit Xaringan)

Xaringan basiert auf remark.js

Beipiele für Xaringan-Präsentationen

1. Alison Hill - RStudio Conf 2019
2. Yongfu Liao - Chocolate Theme
3. Yihui Xie - Presentation Ninja
4. Science Communication with Xaringan/R
5. Emi Tanaka - Kunoichi Theme

Papaja: Eine Vorlage für APA-Manuskripte

yart: Eine Vorlage für Forschungsberichte

Poster mit posterdown

Interaktive Diagramme in HTML

Ja, aber - ich liebe MS Word ...

Eine Seite mit Word, noch ein paar Seiten, und irgendwann ...

Markdown verkraftet auch große Dokumente.

Animationen

Buch "Moderne Datenanalyse mit R" (MODAR)

• ca. 500 Seiten
• ca. 200 Abbildungen
• ca. 200 R-Codes

Relativ großes Doukument.

Keine Schnapp-Atmung beim Bearbeiten/Erstellen, aber relativ lange Kompilationsdauer (ca. 2 Minuten).

Pro MODAR-Kapitel eine Datei

rmd_files: 
[
  "index.Rmd",
  "01_Statistik_heute.Rmd",
  "02_Hallo_R.Rmd",
  "03_R_starten.Rmd",
  "04_Erstkontakt.Rmd",
  # "05_Datenstrukturen.Rmd",
  "06_Datenimport_und_export.Rmd",
  ...
]

MODAR-Metadaten-Datei

title: "Moderne Datenanalyse mit R"
subtitle: "Entwurf"
author: "Sebastian Sauer"
lang: de-De
documentclass: book
classoption: a4paper
fontsize: 11pt
fontfamily: mathpazo
...

MODAR-Beispielseite

🏋 Übung: HTML-Stylesheets

Vorab sind 13 HTML-Formatvorlagen (Stylesheets, Themes) installiert: “cerulean”, “cosmo”, “flatly”, “journal”, “lumen”, “paper”, “readable”, “sandstone”, “simplex”, “spacelab”, “united”, und “yeti”. Hier einige Beispiele.

Probieren Sie verschiedene aus!

---
title: "test"
output:
  html_document:
    theme: united
---

Snytax-Highlighting

Es gibt auch verschiedene Syntax-Highlight-Stile:

highlight specifies the syntax highlighting style. Supported styles include default, tango, pygments, kate, monochrome, espresso, zenburn, haddock, and textmate. Pass null to prevent syntax highlighting.

Überblick

Passen Sie Ihren YAML-Header entsprechend an:

---
title: "test"
output:
  html_document:
    # theme: united
    highlight: tango
---

🏋 Übung: Prettydoc-Stylesheets (für HTML)

1. Installieren Sie das R-Paket prettydoc mit install.packages("prettydoc").
2. Öffnen Sie eine neue Rmd-Datei "from Template"
3. Wählen Sie die prettydoc-Vorlage
4. Basteln Sie nach Herzenslust daran herum.
5. Wählen Sie weitere Vorlagen etc.

Projektseite

🏋 Übung: Chunk-Options

R-Chunks kann man mit Optionen versehen, um die Ausgabe zu steuern.

Entschlüsseln Sie die Bedeutung der Chunk-Optionen!

```{r demo-plot, out.width="70%", fig.align = "center", 
      echo = FALSE, eval = FALSE}
knitr::include_graphics("imgs/modar-sample1.png")
```

Lesen Sie hier mehr über Chunk-Optionen!

Ein Credo zum Textschreiben

Ich glaube, dass man beim Schreiben ...

1. nur schreiben soll, sich nicht schon mit der Formatierung beschäftigen soll.

2. immer nur eine Sache zu einer Zeit tun soll. Man beginne mit der Gliederung, es folgen stichpunktartige Notizen , schließlich formuliere man Sätze , danach erst beginne man mit Formatierung.

3. reichlich von Metatext Gebrauch machen soll, in Sinne von Kommentaren über seinen Text (als Gedankenstütze).

4. zum Schluss auf anspruchsvolle Typografie achten soll (Ästhetik und Lesbarkeit). Allerdings verzichte man auf Schnörkel.

5. nicht einen 500-Seiten-Haufen schreiben soll, sondern intensiv und auf mehreren Ebenen gliedern soll (Ordner, Dateien, Dateien für Bilder oder Daten, Kapitel, Absätze, ...).

Grundlagen des Zitierens

@article{baker_1500_2016,
  title = {1,500 Scientists Lift ...},
  volume = {533},
  issn = {0028-0836, 1476-4687},
  language = {en},
  number = {7604},
  journal = {Nature},
  doi = {10.1038/533452a},
  author = {Baker, Monya},
  month = may,
  year = {2016},
  pages = {452-454}
}

🏋 Übung: Zitieren

1. Erstellen Sie eine Datei namens Literatur.bib im Verzeichnis Ihrer Rmd-Datei.
2. Kopieren Sie einen Zitationseintrag im Bib-Format (s. vorherige Seite) in Ihre Literatur-Datei (oder nehmen Sie diese).
3. Fügen Sie den Namen ihrer Literaturdatei in den YAML-Header ein mit dem Parameter bibliography: <name.bib>.

Wenn Sie keinen Pfad (zu Ihrer Literaturdatei) angeben, so muss diese im gleichen Verzeichnis wie die Rmd-Datei liegen.

---
blablabla
bibliography: Literatur.bib
blablabla
---

Hier finden Sie einen Lösungsvorschlag.

Zitationsstil wählen

Böse Zungen behaupten, es gäbe mehr Zitationsstile als Journals ...

Eine gängige Variante zur Definition von Zitationsstilen ist das CSL-Format.

Um einen Zitationsstil zur Formatierung Ihrer Zitationen anzuwenden, müssen Sie:

• Den Zitationsstil als CSL-Datei herunterladen (z.B. von hier oder von hier, schon als APA6)
• Die CSL-Datei in Ihr Verzeichnis stellen (dort, wo sich auch die Rmd-Datei befindet)
• Im YAML-Header mit dem Parameter csl: <csl-datei.csl> auf die Datei verweisen.

Tabellen 1

Es gibt viele Optionen für Tabellen in Markdown via R, z.B. knitr::kable()

knitr::kable(head(iris), format = "html")

Tabellen 2

DT::datatable(
  head(iris, 5),
  fillContainer = FALSE, options = list(pageLength = 8)
)

Referenzieren von Abschnitten

# Wichtiges Kapitel {#wichtig}
blablabla
# Unwichtiges Kapitel
Man lese im Kapitel \@ref(wichtig).

Das Referenzieren von Kapiteln ist hier nachzulesen.

Um Referenzier-Funktionen der Art @ref(id) nutzen zu können, passen Sie bitte Ihren YAML-Header wie folgt an:

blablabla
output:
  bookdown::pdf_document2
    <weitere-output-angaben>
blablabla

Referenzieren von Abbildungen

Ein Beispiel

Wie in Abbildung \@ref(fig:demo-plot) ersichtlich ...

Referenzieren von Tabellen

mtcars %>% 
  head(3) %>% 
  knitr::kable(caption = "Tabellen-Beschriftung", format = "html")

Wie in Tabelle \@ref(tab:demo-tab) ersichtlich ...

🏋 Übung: Referenzieren

Erstellen Sie eine Dokument, in dem Sie (Kapitel, Abbildungen und/oder Tabellen) referenzieren!

Anstelle von pdf_document2 ist auch html_document2 möglich.

Hier finden Sie einen Lösungsvorschlag.

Buch zum Einstieg

Dieses ist auch gut

Jungwissenschaftler Sebastian S. -- Ein Drama in 3 Akten (1/3)

2. Akt

3. Akt

Wie können wir den Jungwissenschaftler glücklich machen?

Desiderata der Änderungsnachverfolgung beim Texte schreiben

Dateien versionieren -- kann helfen

Wäre es nicht schön ... 1/2

Wenn man Änderungen am Text in zusammengehörigen Bündeln schön übersichtlich sehen könnte?

Betrachten Sie dieses Beispiel-Repo:

https://github.com/sebastiansauer/test_ses

Wäre es nicht schön ... 2/2

Wenn man dann für jedes "Änderungsbündel" die Änderungen schön übersichtlich sehen könnte?

Natürlich sollte Autor und Zeitpunkt der Änderung auch dokumentiert sein.

Je größer das Projekt,

... desto wichtiger ist ein gutes Werkzeug zur Änderungskontrolle

Ein "Änderungsbündel" wird in Git als Commit bezeichnet. Ein Git-Ordner mit allem Drum und Dran wird als Repo(sitorium) bezeichnet.

Beispielprojekt: Statistik-Vorlesungen an der FOM

196 Dokumente in 63 Ordnern, 825 Mb

Solch große Projekten sind nicht gut in Word aufgehoben

Dafür ist Word nicht gemacht.

Auszug aus den Commits im Repo Vorlesungen

Quiz mit Word

1. Wer hat "liegt eine Stichprobe geändert"?
2. Was stand an dieser Stelle davor?
3. Handelt es sich bei der Änderung um eine Ergänzung oder eine Modifikation oder eine Löschung?
4. Ist "Autor" ein Name oder der Urheber des Dokuments?
5. Wann wurden die Änderungen vorgenommen?
6. Wie kann man den Verlauf der Änderungen sehen?

Git-Workflow 1

1. Git starten (Odner für Git initialsieren)
2. Änderungen vornehmen (ggf. an mehreren Dateien)
3. Dateien auswählen, deren Änderungen dokumentiert werden sollen ("adden" oder "stagen")
4. Änderungen einstellen ("committen")
5. Änderungen zum Server replizieren ("pushen")
6. Ggf. Änderungen prüfen und kommentieren

Komponenten eines Git-Projekts

• Repository: Der Container, der alle Dateien und alle Änderungen eines Projekt enthält.

• Working Tree: Dateisystem der Repos in aktueller (oder frühere) Version

• Staging Area (Index): Dokumentiert Dateien mit Änderungen, die noch nicht eingestellt sind.

• Head: Aktuellste Version des Projekts (neuester Commit) im aktuellen Branch

• Branch: Variante des Projekts

Git-Workflow mit Fachbegriffen

Aber lohnt sich Git für mich?

A solo data analyst, working on a single computer, will benefit from adopting version control. But not nearly enough to justify the pain of installation and workflow upheaval. There are much easier ways to get versioned back ups of your files, if that’s all you’re worried about.

In my opinion, for new users, the pros of Git only outweigh the cons when you factor in the overhead of communicating and collaborating with other people.

https://happygitwithr.com/big-picture.html

Github

https://en.wikipedia.org/wiki/GitHub

Git* installieren

1. Account (kostenlos) bei Github anlegen
2. RStudio herunterladen bzw. aktualisieren
3. Git herunterladen/installieren Hinweise
4. Bei Git anmelden
5. Git-Editor (z.B. Github Desktop) installieren

Ein erstes Repo anlegen 1/2

1. Loggen Sie sich bei Github ein.
2. Klicken Sie bei "Repositories" auf New (grüner Knopf).

Ein erstes Repo anlegen 2/2

1. Füllen Sie die Maske aus.
2. Grünen Knopf drücken ("Create Repository"). Fertig!

Das Repo "clonen" 1/2

1. Gehen Sie in das Repo.
2. Klicken Sie auf den grünen Knopf ("Clone or Download"), wählen Sie "Clone".
3. Kopieren Sie den Git-Link heraus, z.B. "git@github.com:sebastiansauer/test_ses.git".

Das Repo "clonen" 2/2

1. Öffnen Sie RStudio
2. Legen Sie ein Git-Projekt an: File > New Project ... > Version Control > Git.
3. Kopieren Sie bei "Repository Url" die Git-Url Ihres Repos ein.
4. Verzeichnisname etc. können Sie nach Belieben wählen.

🏋 Übung: Legen Sie sich ein Github-Repo in RStudio an

Jetzt haben Sie Ihr Repo in RStudio verfügbar.

Vertiefung: Passwörter-Cache mit Git/Github

🏋 Übung: Stellen Sie Änderungen in Ihr Repo ein.

Mögliche Probleme

Das Buch von Jenny Bryant Happy Git with R gibt eine gute Einführung in das Thema.

Dort finden Sich auch Hinweise bei Problemen.

🏋 Übung: Arbeiten Sie im Team

1. Fügen Sie sich in Ihrem Github-Repo gegenseitig als Mitarbeiter hinzu: Settings > Collaborators.
2. Sie müssen dazu die entsprechenden Nutzernamen wissen.
3. Ändern Sie nun etwas an einem Repo, zu dem Sie eingeladen wurden.

Einige Git-Befehle für die Kommandozeile (Terminal)

• git init: Legt in einem Ordner die Git-Infrastruktur an.
• git status: Gibt einen Überblick über den Status eines Repos.
• git add .: Fügt alle Dateien dem Index zu (staged die Dateien).
• git commit -m "meine nachricht". Committed die gestageden Dateien und fügt eine (hoffentlich aussagekräftige) Nachricht hinzu
• git pull: Zieht das Repo vom zentralen Server und mergt es in das lokale Repo.
• git push: Lädt das lokale Repo zum zentraler Server hoch.
• git stash: Speichert die aktuellen Änderungen (sofern noch nicht committed) temporär.
• git blame: Zeigt, wer als letztes eine bestimmte Zeile einer Datei verändert hat.

frühere Zustände betrachten - git checkout <id>

Mit

git checkout a1e8fb5

versetzt man den Working Tree in dem Zustand des Commits mit der ID a1e8fb5.

Man kann jetzt keine Änderungen vornehmen (detached head), sondern nur alte Zustände betrachten¹.

Mit git checkout master kommt man wieder zum aktuellen Stand auf dem Branch master.

1: Aber man kann von diesem Zustand aus einen neuen Branch öffnen mit z.B git checkout -b my_new_branch.

Frühere Zustände wiederherstellen 3/3 - git checkout <commit-hash> <file>

git checkout git checkout bdcd88fdf18bce554046b4188e0a8aee0b5f1b0a Tweets-Data/party_tweets.Rda

Damit wird eine Datei/ein Ordner aus dem Commit <commit-hash> im Working Directory wiederhergestellt.

Mit

git reset HEAD~2 foo.R

Wird die Datei foo.R aus dem 2. letzten Commit wiederhergestellt.

https://www.atlassian.com/git/tutorials/resetting-checking-out-and-reverting

Frühere Zustände wiederherstellen 2/3 - git revert

Einen früheren Commit wiederherstellen:

git revert HEAD

Damit wird der Zustand

Anstelle von HEAD kann man auch eine Commit-ID angeben.

https://www.atlassian.com/git/tutorials/undoing-changes/git-revert

Frühere Zustände wiederherstellen 3/3 - git reset

So widerrufen Sie Änderungen unwiderruflich:

git reset --hard HEAD~

Working Tree und HEAD werden auf den Vorfahren des Heads zurückgesetzt. Der Index ist leer (keine Dateien auf der Staging Area).

So löscht man Änderungen im Working Directory (d.h. nicht committed)

git reset --hard

git reset zum Unstaggen aller Dateien

Buch Pro Git zum Einstieg und Vertiefen

freie Online-Version

OK, es kann auch Probleme geben

StackOverflow ist der Retter in Not.

Literatur

Baker, M. (2016). "1,500 Scientists Lift the Lid on Reproducibility". En. In: Nature 533.7604, pp. 452-454. ISSN: 0028-0836, 1476-4687. DOI: 10.1038/533452a.

Goodman, S. N, D. Fanelli, and J. P. A. Ioannidis (2016). "What Does Research Reproducibility Mean?" In: Science Translational Medicine 8.341, pp. 341ps12-341ps12. ISSN: 1946-6234, 1946-6242. DOI: 10.1126/scitranslmed.aaf5027.

McElreath, R. (2016). Statistical Rethinking. New York City, NY: Apple Academic Press Inc.. ISBN: 1-4822-5344-5.

Jetzt sind Sie dran

Reproducibility

• Versions of employed software as of 2019-09-16, running this OS: macOS Mojave 10.14.6.
• Built with R, R version 3.6.0 (2019-04-26), RStudio 1.2.1335, xaringan, on the shoulders of giants
• Icons are from FontAwesome, licenced under CC-BY-4 (details)
• R-Packages used: assertthat_0.2.1, backports_1.1.4, bibtex_0.4.2, brew_1.0-6, broom_0.5.2, cellranger_1.1.0, cli_1.1.0, codetools_0.2-16, colorspace_1.4-1, crayon_1.3.4, crosstalk_1.0.0, curl_3.3, data.table_1.12.2, DiagrammeR_1.0.1, DiagrammeRsvg_0.1, digest_0.6.20, downloader_0.4, dplyr_0.8.3, DT_0.7, emo_0.0.0.9000, evaluate_0.14, forcats_0.4.0, generics_0.0.2, ggdendro_0.1-20, ggformula_0.9.1, ggplot2_3.2.0, ggrepel_0.8.1, ggstance_0.3.2, glue_1.3.1.9000, gridExtra_2.3, gtable_0.3.0, haven_2.1.1, here_0.1, highr_0.8, hms_0.5.0, htmltools_0.3.6, htmlwidgets_1.3, httpuv_1.5.1, httr_1.4.0, icon_0.1.0, igraph_1.2.4.1, influenceR_0.1.0, jsonlite_1.6, knitr_1.23, later_0.8.0, lattice_0.20-38, lazyeval_0.2.2, leaflet_2.0.2, lubridate_1.7.4, magrittr_1.5, MASS_7.3-51.4, Matrix_1.2-17, mime_0.7, modelr_0.1.4, mosaic_1.5.0.9001, mosaicCore_0.6.0, mosaicData_0.17.0, munsell_0.5.0, nlme_3.1-140, pillar_1.4.2, pkgconfig_2.0.2, plotly_4.9.0, plyr_1.8.4, promises_1.0.1, purrr_0.3.2, R6_2.4.0, RColorBrewer_1.1-2, Rcpp_1.0.1, readr_1.3.1, readxl_1.3.1, RefManageR_1.2.12, rgexf_0.15.3, rlang_0.4.0, rmarkdown_1.14, Rook_1.1-1, rprojroot_1.3-2, rstudioapi_0.10, rvest_0.3.4, scales_1.0.0, sessioninfo_1.1.1.9000, shiny_1.3.2, stringi_1.4.3, stringr_1.4.0, tibble_2.1.3, tidyr_0.8.3, tidyselect_0.2.5, tidyverse_1.2.1, V8_2.3, vctrs_0.2.0, viridis_0.5.1, viridisLite_0.3.0, visNetwork_2.0.7, widgetframe_0.3.1, withr_2.1.2, xaringan_0.11, xaringanthemer_0.2.0, xfun_0.8, XML_3.98-1.20, xml2_1.2.0, xtable_1.8-4, yaml_2.2.0, zeallot_0.1.0
• Last update 2019-09-16 09:55:13