Visualizing variation in data, simple ideas

1 Load packages

library(tidyverse)  # data wrangling

2 Simulate data

low_spread <- 
  tibble(var = rnorm(n = 100),
         id = 1:100,
         type = "low spread")
high_spread <-
  tibble(var= rnorm(n = 100, sd = 10),
         id = 1:100,
         type = "high spread")
d <-
  low_spread %>% 
  bind_rows(high_spread)

3 Plot 1

ggplot(d) +
  aes(x = id, y = var) +
  facet_wrap(~ type) +
  geom_hline(yintercept = 0, color = "grey40") +
  geom_point() +
  theme_minimal()

4 Plot 2

ggplot(d) +
  aes(x = type, y = var) +
  geom_boxplot()

5 Plot 3

ggplot(d) +
  aes(x = var, fill = type) +
  geom_density(alpha = .5)

6 Plot 4

d2 <-
  d %>% 
  group_by(type) %>% 
  mutate(avg = mean(var)) %>% 
  ungroup() %>% 
  mutate(delta = var - avg)
  
ggplot(d2) +
  aes(x = id, y = var) +
  facet_wrap(~ type) +
  geom_hline(yintercept = 0, color = "grey40") +
  geom_point() +
  theme_minimal() +
  geom_errorbar(aes(x = id, ymin = var-delta, ymax = var), color = "blue")

7 Reproducibility

#> ─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
#>  setting  value                       
#>  version  R version 4.1.3 (2022-03-10)
#>  os       macOS Big Sur/Monterey 10.16
#>  system   x86_64, darwin17.0          
#>  ui       X11                         
#>  language (EN)                        
#>  collate  en_US.UTF-8                 
#>  ctype    en_US.UTF-8                 
#>  tz       Europe/Berlin               
#>  date     2022-04-02                  
#> 
#> ─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
#>  package     * version date       lib source                            
#>  assertthat    0.2.1   2019-03-21 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  backports     1.4.1   2021-12-13 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  blogdown      1.8     2022-02-16 [2] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  bookdown      0.24.2  2021-10-15 [1] Github (rstudio/bookdown@ba51c26) 
#>  brio          1.1.3   2021-11-30 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  broom         0.7.12  2022-01-28 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  bslib         0.3.1   2021-10-06 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  cachem        1.0.6   2021-08-19 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  callr         3.7.0   2021-04-20 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  cellranger    1.1.0   2016-07-27 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  cli           3.2.0   2022-02-14 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  codetools     0.2-18  2020-11-04 [2] CRAN (R 4.1.3)                    
#>  colorout    * 1.2-2   2022-01-04 [1] Github (jalvesaq/colorout@79931fd)
#>  colorspace    2.0-3   2022-02-21 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  crayon        1.5.0   2022-02-14 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  DBI           1.1.2   2021-12-20 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  dbplyr        2.1.1   2021-04-06 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  desc          1.4.0   2021-09-28 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  devtools      2.4.3   2021-11-30 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  digest        0.6.29  2021-12-01 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  dplyr       * 1.0.8   2022-02-08 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  ellipsis      0.3.2   2021-04-29 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  evaluate      0.14    2019-05-28 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  fansi         1.0.2   2022-01-14 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  farver        2.1.0   2021-02-28 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  fastmap       1.1.0   2021-01-25 [2] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  forcats     * 0.5.1   2021-01-27 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  fs            1.5.2   2021-12-08 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  generics      0.1.2   2022-01-31 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  ggplot2     * 3.3.5   2021-06-25 [2] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  glue          1.6.2   2022-02-24 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  gtable        0.3.0   2019-03-25 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  haven         2.4.3   2021-08-04 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  highr         0.9     2021-04-16 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  hms           1.1.1   2021-09-26 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  htmltools     0.5.2   2021-08-25 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  httr          1.4.2   2020-07-20 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  jquerylib     0.1.4   2021-04-26 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  jsonlite      1.7.3   2022-01-17 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  knitr         1.37    2021-12-16 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  labeling      0.4.2   2020-10-20 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  lifecycle     1.0.1   2021-09-24 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  lubridate     1.8.0   2021-10-07 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  magrittr      2.0.2   2022-01-26 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  memoise       2.0.0   2021-01-26 [2] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  modelr        0.1.8   2020-05-19 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  munsell       0.5.0   2018-06-12 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  pillar        1.7.0   2022-02-01 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  pkgbuild      1.2.0   2020-12-15 [2] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  pkgconfig     2.0.3   2019-09-22 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  pkgload       1.2.4   2021-11-30 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  prettyunits   1.1.1   2020-01-24 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  processx      3.5.2   2021-04-30 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  ps            1.6.0   2021-02-28 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  purrr       * 0.3.4   2020-04-17 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  R6            2.5.1   2021-08-19 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  Rcpp          1.0.8   2022-01-13 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  readr       * 2.1.2   2022-01-30 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  readxl        1.3.1   2019-03-13 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  remotes       2.4.0   2021-06-02 [2] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  reprex        2.0.1   2021-08-05 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  rlang         1.0.2   2022-03-04 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  rmarkdown     2.11    2021-09-14 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  rprojroot     2.0.2   2020-11-15 [2] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  rstudioapi    0.13    2020-11-12 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  rvest         1.0.2   2021-10-16 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  sass          0.4.0   2021-05-12 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  scales        1.1.1   2020-05-11 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  sessioninfo   1.1.1   2018-11-05 [2] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  stringi       1.7.6   2021-11-29 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  stringr     * 1.4.0   2019-02-10 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  testthat      3.1.2   2022-01-20 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  tibble      * 3.1.6   2021-11-07 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  tidyr       * 1.2.0   2022-02-01 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  tidyselect    1.1.2   2022-02-21 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  tidyverse   * 1.3.1   2021-04-15 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  tzdb          0.1.2   2021-07-20 [2] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  usethis       2.0.1   2021-02-10 [2] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  utf8          1.2.2   2021-07-24 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  vctrs         0.3.8   2021-04-29 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  withr         2.5.0   2022-03-03 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#>  xfun          0.29    2021-12-14 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  xml2          1.3.3   2021-11-30 [1] CRAN (R 4.1.0)                    
#>  yaml          2.2.2   2022-01-25 [1] CRAN (R 4.1.2)                    
#> 
#> [1] /Users/sebastiansaueruser/Library/R/x86_64/4.1/library
#> [2] /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.1/Resources/library